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《疾病监测》主要报道急、慢性传染病，慢性非传染性疾病、伤害、寄生虫病、地方病等防治成果；卫生统计、环境医学、职业卫生、学校卫生、健康促进、健康教育等方面的研究成果；与疾病控制关系密切的实践经验；新理论、新技术、新方法等具体而详实的监测工作和先进的检测技术；述评、专题讲座以及反映中国国内外相关学科重要进展的综述及公共卫生突发事件调查等

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