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《西南医科大学学报》主要刊载基础医学、实验研究、中医与中西医结合、临床医学、技术方法、药学研究、综述与讲座、护理医学、病案报告等文稿。主要栏目设有：基础医学研究、临床医学研究、护理学、综述与讲座。

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