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《生物加工过程》被《中国科技核心期刊》、《科学引文数据库》（SCD）、《中国学术期刊综合评价数据库》《中国期刊全文数据库》、《中国生物学文摘》、RCCSE中国核心学术期刊（A）、《万方数据资源系统数字化期刊》、台湾华艺思博网等中文数据库、美国《生物学文摘（预评）》、美国《化学文摘（网络版）》（CA）、英国《国际农业与生物科学研究中心》（CABI）、美国《剑桥科学文摘》（CSA）、波兰《哥白尼索引》、美国《乌利希期刊指南（网络版）》（Ulrichsweb）等中国国内外数据库收录。

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